Po stażu i LEK lekarz może leczyć samodzielnie. Żeby zostać chirurgiem, pediatrą albo lekarzem rodzinnym, musi jeszcze odbyć szkolenie specjalizacyjne: od czterech do sześciu lat pracy według programu, zakończone Państwowym Egzaminem Specjalizacyjnym (PES).
Rozporządzenie wymienia 77 specjalizacji, a 69 z nich można zacząć zaraz po stażu. Rezydentury przyznaje i finansuje minister zdrowia: od 1 lipca 2026 r. wynagrodzenie zasadnicze to 10 595,24 zł brutto miesięcznie, a w 23 dziedzinach priorytetowych 11 654,76 zł. Miejsca pozarezydenckie to pozostałe wolne miejsca w placówkach uprawnionych do szkolenia. Pensji z puli ministra przy nich nie ma.
Egzaminu wstępnego nie ma. Wniosek składa się dwa razy w roku i można w nim wskazać do 15 wariantów, czyli połączeń dziedziny, województwa i trybu. Gdy chętnych jest więcej niż miejsc, kolejność ustala ranking, w którym liczy się przede wszystkim wynik LEK.
W sumie miejsc jest więcej niż chętnych. Jesienią 2025 r. było ich 14 598, przyjęcie potwierdziło 5 483 lekarzy i lekarzy dentystów, więc puste zostało 62%. W pojedynczych dziedzinach bywa odwrotnie: w chirurgii plastycznej na miejsce przypadało 7,47 kandydata.
PES to test ze 120 pytań, zdany od 60%, i egzamin ustny, z którego zwalnia co najmniej 75% z testu. W 2025 r. zdanych było 80,3% podejść do testu, a wśród osób zdających po raz pierwszy 89,5%.